Il termine utile per l’annullamento d'ufficio sugli atti amministrativi illegittimi è stato ridotto a 6 mesi (rispetto al termine inizialmente fissato in 18 mesi).

È più facile per cittadini e imprese dimostrare di aver ottenuto un’autorizzazione per silenzio-assenso: l’attestazione dell’avvenuta formazione del silenzio-assenso è ora inviata direttamente dall’amministrazione, una volta decorsi i termini del procedimento. Inoltre, sono individuati in modo tassativo i casi in cui il silenzio-assenso non può formarsi, aumentando la certezza sul funzionamento dell’istituto per cittadini e imprese.

Si rendono, infine, più semplici i lavori della conferenza di servizi, riducendo i termini e prevedendo modalità ulteriormente semplificate. 
In particolare, si riducono i termini da 45 a 30 giorni (e da 90 a 60, nei casi in cui sono coinvolte amministrazioni preposte alla tutela ambientale, paesaggistico territoriale, dei beni culturali o della salute dei cittadini) sia per la conclusione della conferenza svolta in forma simultanea, sia per le determinazioni delle amministrazioni nella conferenza semplificata. Si riducono anche i termini (da 45 a 30 giorni) in cui deve essere convocata la riunione della conferenza simultanea, nell’eventualità in cui la complessità delle determinazioni da assumere porti a svolgere la conferenza direttamente in modalità simultanea e sincrona.
È introdotto un nuovo iter (meno articolato rispetto all’iter precedentemente previsto) da seguire nei casi in cui, nel corso della conferenza di servizi decisoria semplificata, si renda necessario procedere all’esame contestuale degli interessi coinvolti. Il nuovo iter prevede lo svolgimento di una riunione telematica e la redazione della determinazione conclusiva senza ritardo.
Si rafforza infine il principio del “dissenso costruttivo”: le amministrazioni dovranno indicare prescrizioni e misure mitigatrici utili a consentire modifiche del progetto e favorire l’esito positivo del procedimento.